Durch eine gewaltige Gravitationsanomalie wird die Enterprise in eine unbekannte Galaxie geschleudert. Selbst wenn Captain Kirk und seine Crew wüssten, wo sie sich befinden, würde der Rückflug zur Föderation Jahrhunderte dauern. Auf der Suche nach intelligentem Leben entdeckt die Crew, dass sämtliche einst bewohnte Planeten in einem interstellaren Krieg in radioaktive Wüsten verwandelt wurden. Als die Enterprise endlich auf eine raumfahrende Zivilisation trifft, wird sie sofort unter Beschuss genommen. Und dann taucht ein zweites Schiff auf - die Enterprise gerät zwischen die Fronten.